原子吸收測定速度快，準確度高。但不能用於陰離子和有機物的檢測。另外使用成本高，對環境要求高，在基層單位用戶推廣應用有一定難度。
電化學儀器使用金屬汞做工作電極，有汙染環境之嫌，但可用於陽離子、陰離子、有機物等分析，購買、維護、運營費用低，投資回報率高，易於推廣。有很多國標、行業標準都使用電化學極譜方法及溶出法。因此高端用戶用原子吸收多，縣級及以下用戶用電化學儀器多。
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